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EVALUACIÓN DE LA DIVERSIDAD MICROBIANA Y GENES DE BIODEGRADACIÓN DE ALCANOS EN RESIDUOS DE SENTINAS DEL PUERTO DE MAR DEL PLATA

CORTI MONZÓN, Georgina 1 | PERESSUTTI, Silvia R2 | NISENBAUM, Melina3 | HOZBOR, Constanza4 | JUNCA, Howard5 | MURIALDO, Silvia1 I

INSTITUTO DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA DE ALIMENTOS Y AMBIENTE (INCITAA), FAC. INGENIERÍA, UNMDP 1; INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACIÓN Y DESARROLLO PESQUERO (INIDEP), MAR DEL PLATA 2; INSTITUTO DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA DE ALIMENTOS Y AMBIENTE (INCITAA), FACULTAD INGENIERÍA, UNMDP 3; INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACIÓN Y DESARROLLO PESQUERO (INIDEP), MAR DEL PLATA 4; RG MICROBIAL ECOLOGY: METABOLISM, GENOMICS& EVOLUTION, MICROBIOMAS FOUNDATION 5


Introducción y Objetivos:
Los microorganismos son la fuente principal de biodiversidad en nuestro planeta y juegan un papel esencial en el mantenimiento de los ciclos biogeoquímicos y en diversos procesos como la depuración de ambientes contaminados. En los últimos años, las técnicas metagenómicas han brindado una nueva perspectiva sobre la diversidad microbiana y su funcionalidad en estos ambientes y su potencial genómico. Las aguas de sentina son residuos peligrosos generados en los barcos, que poseen un alto contenido de hidrocarburos (HC). El objetivo del presente trabajo fue estudiar la composición de las comunidades microbianas presentes en residuos de sentinas mediante secuenciación masiva del gen ARNr 16S (Ilumina), y evaluar la ocurrencia del gen biomarcador de degradación de alcanos alkB utilizando la técnica de PCR-DGGE, con la finalidad de estimar el potencial de biodegradación de estas comunidades
Materiales y Métodos:
Se identificaron las bacterias presentes en muestras de aguas de sentinas de un buque de altura (A), una lancha costera (C), una draga (D) y otra de agua de sentina estancada para su posterior tratamiento (M), todas provenientes del puerto de Mar del Plata, Argentina, mediante secuenciación del gen ARNr 16S. Por otro lado se evaluó la ocurrencia del gen alkB utilizando la técnica de PCR-DGGE.
Resultados:
Los resultados mostraron una gran diversidad bacteriana en las diferentes muestras de sentina, con predominancia de OTUs con géneros asociados a la degradación de HC, como Thalassopira, Parvibaculum, y Alcanivorax en sentinas A, C y M, y Thiococcus y Pseudomonas en D. Otros miembros como Marinobacter, Dongia, Marispirillum fueron ubicuos en las muestras. El gen alkB mostró variación en los perfiles de PCR-DGGE entre las diferentes muestras de sentinas. Se evidenció una diversidad genética considerable de genes alkB predominantes en las muestras de sentinas, con un total de 19 bandas diferentes detectadas. Las secuencias genéticas obtenidas de las bandas se afiliaron en el GenBank con genes descriptos en cepas de los géneros Rhodococcus, Marinobacter, Alcanivorax y Pseudomonas y también con genes de bacterias no cultivables provenientes de muestras ambientales contaminadas con HC. A su vez, el estudio de diversidad por secuenciación masiva indicó la abundancia de géneros como Sabulilitoribacter y Nisaea, entre otros, para los cuales no se han descripto genes alkB o no se han asociado a degradación de HC. Estos géneros serían candidatos para estudios sobre la identificación de caminos metabólicos relacionados con procesos de biodegradación de HC.
Conclusiones:
Los resultados de este trabajo contribuyen al conocimiento sobre la diversidad y funcionalidad de comunidades bacterianas autóctonas claves para el tratamiento de estos residuos. Junto con resultados previos obtenidos por nuestro grupo de trabajo, constituyen la base para la generación de nuevas tecnologías para el tratamiento de residuos de sentinas generados en el Puerto de Mar del Plata.


ISSN 1666-7948
www.quimicaviva.qb.fcen.uba.ar

Revista QuímicaViva
Número 3, año 18, Diciembre 2019
quimicaviva@qb.fcen.uba.ar